Em cada linha de investigação, as acções operacionais anuais são realizadas da seguinte forma:
| Sub-linhas |
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| Administração de negócios e gerenciamento de talentos humanos |
| Informações contábeis e planos de auditoria de acordo com os padrões estabelecidos |
| Estratégias de marketing e mercados potenciais |
| Sub-linhas |
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| Desenvolvimento de conhecimento e tecnologias para agricultura alternativa aplicável às condições dos trópicos úmidos e semi-úmidos do litoral equatoriano. |
| Desenvolvimento e gerenciamento de variedades e híbridos em culturas de interesse estratégico para o Equador. |
| Melhoria de espécies vegetais e produtos orgânicos |
| Desenvolvimento econômico e social na área de influência da UTEQ. |
| Desenvolvimento de sistemas de produção que promovam o uso eficiente dos recursos genéticos. |
| Manejo de ecossistemas florestais, processamento de madeira e agroecologia |
| Estratégias de gerenciamento de doenças e pragas em sistemas agrícolas e florestais. |
| Sub-linhas |
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| Desenvolvimento de sistemas de produção que promovam o uso eficiente de recursos genéticos vegetais. |
| Melhoria nutricional, conservação de gramíneas, leguminosas, árvores forrageiras, subprodutos agrícolas e resíduos agroindustriais para alimentação animal. |
| Desenvolvimento de sistemas alternativos de produção em aquicultura |
| Desenvolvimento de sistemas de produção de aves |
| Desenvolvimento de sistemas agrícolas que contribuam para a segurança alimentar, a economia e o gerenciamento sustentável dos recursos naturais. |
| Biodiversidade, planejamento do uso da terra e sustentabilidade ambiental de assentamentos humanos |
| Biologia da conservação |
| Sub-linhas |
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| Valorização dos resíduos agro-industriais. |
| Gestão, inovação, desenvolvimento e sustentabilidade de processos e produtos alimentares e não alimentares. |
| Gerenciamento, inovação, desenvolvimento e sustentabilidade de produtos alimentícios |
| Sub-linhas |
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| Avaliação da qualidade da água, do ar e do solo, incluindo alternativas de mitigação dos impactos ambientais. |
| Desenvolvimento de soluções tecnológicas para a gestão de resíduos e promoção de energias alternativas. |
| Desenvolvimento de sistemas de produção que promovam a utilização eficiente dos recursos ambientais. |
| Desenvolvimento, conservação e proteção de recursos hídricos e ecossistemas |
| Biologia de gerenciamento em face das mudanças climáticas |
| Desenvolvimento arquitetônico e urbano |
| Desenvolvimento arquitetônico e urbano |
| Sub-linhas |
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| Desenvolvimento econômico e social na área de influência da UTEQ |
| Administração pública, inovação e empreendedorismo |
| Estratégias financeiras para o desenvolvimento de negócios |
| Sub-linhas |
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| Inovação, planeamento, execução e avaliação curricular. |
| Ensino em nível de educação básica |
| Processo de ensino-aprendizagem de idiomas |
| Desempenho psicopedagógico |
| Sub-linhas |
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| Eficiência energética e energias renováveis |
| Projeto, construção e manutenção de sistemas mecânicos |
| Sub-linhas |
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| Sistema de cuidados de saúde, controlo e prevenção. |
| Sub-linhas |
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| Desenvolvimento, concepção e gestão de tecnologia industrial e de fabrico. |
| Concepção, simulação e prototipagem de elementos de máquinas, mecanismos, estruturas e sistemas térmicos. |
| Concepção, montagem, disposição física e colocação em funcionamento de instalações industriais com tecnologia adaptada e/ou modificada. |
| Ergonomia e psicossociologia. |
| Segurança no trabalho. |
| Sub-linhas |
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| Engenharia de software e aplicativos de segurança da informação |
| Inovação em sistemas telemáticos e eletrônicos |