A Pós-graduação oferece quatro programas de mestrado.
Estes programas são: Mestrado em Gestão Florestal Sustentável (terceiro coorte), Mestrado em Gestão Ambiental (quarto coorte) e os novos programas de Mestrado em Produção Animal e Administração de Empresas.
Os interessados em prosseguir os estudos do quarto nível devem dirigir-se aos escritórios do Secretariado da Unidade de Pós-Graduação, para obterem mais informações e cumprirem os requisitos até 7 de Janeiro de 2019, data de abertura das inscrições.